要注销公司用你的身份证办理的车牌号，需先与公司协商或走法律途径。从法律上讲，身份证属个人专属证件，未经允许不得擅自使用。若公司拒绝配合，或此行为已对你造成经济损失、信用受损等，问题就严重了，应及时找律师协助解决。
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从法律角度看，处理此问题常见方式有：一是与公司协商，要求注销并赔偿可能造成的损失；二是向交管部门举报，说明情况并要求注销；三是若协商无果，可提起民事诉讼，要求公司承担侵权责任。选择时，若公司态度积极，可先尝试协商；若公司不配合，或想快速解决问题，可考虑直接举报或诉讼。
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具体操作如下：
1. 协商方式：与公司法务或负责人面谈，明确提出要求注销车牌并赔偿损失，保留沟通记录作为证据。
2. 举报方式：携带身份证、工作证明及车牌信息等材料，前往当地交管部门，详细说明情况并要求注销车牌。交管部门会进行调查处理。
3. 诉讼方式：聘请律师，准备起诉状、证据材料（如身份证复印件、工作合同、车牌信息等），向法院提起诉讼。法院将依法审理，判决公司承担相应责任。在诉讼过程中，要积极配合律师，提供必要证据和信息。